MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia hermsii DAH clone fragment 983

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187144	TAA	2	6	30	35	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187144	A	7	7	34	40	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187144	GCA	2	6	113	118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NT_187144	AGCAA	2	10	159	168	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NT_187144	CTG	2	6	217	222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NT_187144	G	7	7	224	230	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187144	TGC	2	6	231	236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NT_187144	AAG	2	6	293	298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187144	TGT	2	6	306	311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187144	GTT	2	6	316	321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187144	GTG	2	6	370	375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187144	ATG	2	6	394	399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187144	ATT	2	6	459	464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187144	TGA	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187144	AAG	2	6	505	510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187144	TAAT	2	8	585	592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187144	TCTT	2	8	637	644	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NT_187144	TTAT	2	8	665	672	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187144	AGG	2	6	704	709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187144	A	7	7	715	721	100 %	0 %	0 %	0 %	426202378
21	NT_187144	AAT	3	9	741	749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202378
22	NT_187144	TTTA	2	8	753	760	25 %	75 %	0 %	0 %	426202378
23	NT_187144	AAG	2	6	973	978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202378
24	NT_187144	TTG	2	6	1040	1045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202378
25	NT_187144	AAG	2	6	1076	1081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202378
26	NT_187144	TTA	2	6	1106	1111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202378
27	NT_187144	CAA	2	6	1154	1159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202378
28	NT_187144	GAAG	2	8	1209	1216	50 %	0 %	50 %	0 %	426202378
29	NT_187144	GATGCT	2	12	1225	1236	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	426202378
30	NT_187144	GAT	2	6	1243	1248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202378
31	NT_187144	AAGA	2	8	1252	1259	75 %	0 %	25 %	0 %	426202378
32	NT_187144	ATT	2	6	1269	1274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202378
33	NT_187144	AGC	2	6	1320	1325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202378
34	NT_187144	ATA	2	6	1466	1471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202378
35	NT_187144	A	6	6	1471	1476	100 %	0 %	0 %	0 %	426202378
36	NT_187144	A	7	7	1494	1500	100 %	0 %	0 %	0 %	426202378
37	NT_187144	TGC	2	6	1512	1517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202378
38	NT_187144	ACG	2	6	1588	1593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202378
39	NT_187144	GCA	3	9	1603	1611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202378
40	NT_187144	TAA	2	6	1640	1645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202378
41	NT_187144	AAG	2	6	1712	1717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202378
42	NT_187144	CAA	2	6	1751	1756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202378
43	NT_187144	TAAG	2	8	1864	1871	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187144	TGTA	2	8	1964	1971	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187144	ATAA	2	8	2000	2007	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187144	TAAT	2	8	2050	2057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187144	TG	3	6	2077	2082	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187144	GCA	2	6	2089	2094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NT_187144	GAAA	2	8	2119	2126	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187144	ATA	2	6	2140	2145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187144	TTTA	2	8	2151	2158	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187144	G	6	6	2235	2240	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187144	T	6	6	2246	2251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187144	CAT	2	6	2263	2268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NT_187144	ACA	2	6	2343	2348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NT_187144	A	6	6	2380	2385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187144	GAT	2	6	2388	2393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187144	ATTA	2	8	2409	2416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187144	CTA	2	6	2456	2461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NT_187144	TAAA	2	8	2474	2481	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187144	CTT	2	6	2521	2526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NT_187144	AAGGG	2	10	2539	2548	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187144	TTTTA	2	10	2562	2571	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187144	A	7	7	2571	2577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NT_187144	TAA	2	6	2582	2587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187144	ACA	2	6	2600	2605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.